Las cuencas fluviales con más recursos hídricos son el Ibaizabal, con 980 hm3/año, el Oria con 690 hm3/año y el Zadorra, con 569 hm3/año. Ibaizabal y Oria suponen la mitad de los recursos de la vertiente cantábrica y el Zadorra representa esta misma proporción de los recursos de la vertiente mediterránea.
Las aportaciones presentan una oscilación interanual más acusada que la de la precipitación, como es habitual en este tipo de procesos. Esta variabilidad es ligeramente mas acusada en las cuencas vertientes al Ebro que en las Cantábricas y mucho mas acusada en las cuencas pequeñas que en las grandes. En la vertiente Cantábrica las aportaciones oscilan, en el período 1951-2000, entre un máximo de 5500 hm3/año y un mínimo de 1500 hm3/año. En la Mediterránea el máximo alcanza los 1800 hm3/año y el mínimo es de 450 hm3/año.